Buveinių apsaugai svarbios teritorijos (BAST). Jų apsaugą reglamentuoja Europos Tarybos direktyva dėl natūralių buveinių ir laukinės faunos bei floros apsaugos (92/43/EEB).Šios direktyvos tikslas skatinti biologinės įvairovės palaikymą, atsižvelgiant į ekonominius, socialinius, kultūrinius ir regioninius reikalavimus, prisidėti prie bendro subalansuotos plėtros siekio, išlaikyti biologinę įvairovę, o tam tikrais atvejais palaikyti ar netgi skatinti žmogaus veiklą.

Anykščių regioninio parko teritorijoje yra išskirtos 9 Buveinių apsaugai svarbios teritorijos (BAST):

• Anykščių šilelis (LTANY0012);
• Girelės miškas (LTANY0011);
• Šventosios upė žemiau Andrioniškio (LTUKM0002);
• Virintos upė (LTANY0004);
• Variaus upelio slėnis (LTANY0009);
• Vilkatėnų miškas (LTANY0001);
• Pavirinčių-Pakalnių pelkė (LTANY0002);
• Rubikių ežeras ir jo apyežerės (LTANY0019);
• Šventosios senvagės (LTANY0020)

Šiose BAST teritorijose  aptinkamos šios Europos Bendrijos svarbos buveinės:

• 9010 vakarų taiga;
• 7140 tarpinės pelkės ir liūnai;
• 6210 stepinės pievos;
• 3260 upių sraunumos su kurklių bendrijomis;
• 6450 aliuvinės pievos;
• 8220 silikatinių uolienų atodangos;
• 3160 natūralūs distrofiniai ežerai;
• 91D0 pelkiniai miškai.